Nanotube Modeler(碳纳米管画图软件)

　　Nanotube Modeler是一款简单易用的碳纳米管画图软件，软件旨在帮助用户通过简单的方式生成纳米管与纳米锥xyz坐标，并支持切换原子、切换键、切换投影、线框模型、空间填充模型等多种不同的视图类型ging用户进行选择，另外，还为您提供MOL查看器、PDB查看器、CIF查看器、VRML查看器、发射POV-Ray、XY工作表生成器、半径计算器、纳米孔阵列、多层石墨烯等丰富的工具，为您带来完善的碳纳米管绘图方案，有需要的朋友赶紧到本站下载吧！

软件功能

　　交互式图形（通过鼠标拖动旋转结构）

　　制作纳米管，纳米锥，布基球，石墨烯片

　　创建带盖（9,0）和（5,5）管

　　管变形的应用

　　创建单壁或多壁纳米管（SWNT，MWNT）

　　导出XYZ，JPG，BMP，PDF，MOL，XMOL，PDB，CIF，VRML，POV文件

　　导入XY图纸坐标文件（可以卷成管）

　　展示来自IMM的Drexler-Merkle分子机器

　　XY图纸生成工具（图像搜索/手动组装）

　　纳米管异质结（使用CoNTub插件）

　　导入XMOL坐标文件（可以将变形应用于纳米管数据）

　　加盖的管（6,6），（10,0）和（10,10）

　　按翻译单位数创建试管

　　自定义MWNT输入/半径计算器/ MWNT序列查找器

　　原子数增加，用于更长的管

　　彩虹色模式

　　ICSD样式的原子数据块的新CIF输出选项

　　用户为MOL文件导出指定的债券定单

　　针对欧洲客户进行了修改（小数点/逗号问题）

　　选择一个或两个盖帽作为盖帽管

　　超长管（> 100,000 A）

　　导出债券连接文件

　　导出MLM文件（敏捷分子）

　　导出纳米孔阵列

　　导出VRML1.0（除了VRML2.0）

　　多层石墨烯片

　　多层石墨烯片的旋转选项

软件特色

　　Nanotube Modeler是一款高级软件应用程序，专门用于帮助您生成纳米管和纳米锥的x，y和z坐标，并使用集成的查看器或您选择的外部程序对其进行分析。

　　此外，该工具还可以使用交互式图形创建布基球和石墨烯片。

　　用户界面

　　GUI在主窗口中显示当前对象的结构。您可以使用鼠标拖动动作以从不同角度可视化对象。

　　该工具使您可以选择对象类型，即纳米管，纳纳酮，石墨烯片，锥片，布基球。另外，您可以访问Fullerene库（CC1或XYZ文件格式）或启用病毒几何模式。

　　查看选项，管变形和原子坐标

　　借助Nanotube Modeler，您可以在工作环境中隐藏或显示原子和键，调整原子和键的大小，围绕x，y或z轴旋转对象，以及在几种立体模式（平行，十字眼或浮雕）。

　　该应用程序支持管变形，并允许您在主面板中预览带有原子坐标的列表。您可以从Fullerene，XMOL，XY或IMM PDB数据导入结构，将结构导出为MOL，XMOL，PDB，CIF，VRML，PDF或MLM文件格式，然后将图像和XYZ表复制到剪贴板。

　　特殊查看器可用于分析MOL，PDB，CIF，VRML和POV结构，或者您可以配置用户定义的结构。您可以更改背景，原子和键的颜色。

　　综合考虑所有因素，Nanotube Modeler集成了多种强大的功能，可帮助您生成纳米管或其他对象的坐标。

安装方法

　　1、下载并解压软件，双击安装程序进入Nanotube Modeler安装向导，单击【next】。

　　2、选择安装位置，用户可以选择默认的C:\Program Files\NanoTube，也可以自定义。

　　3、正在安装Nanotube Modeler，用户等待安装完成。

　　4、弹出如下的Nanotube Modeler安装成功的提示，点击【finish】结束。

使用说明

　　工具栏

　　将XYZ坐标另存为* .txt文件

　　将XYZ坐标复制到剪贴板

　　重新计算几何（也是Enter键）

　　绕屏幕水平轴自动旋转（鼠标右键单击可前进90度）

　　绕垂直屏幕轴自动旋转（鼠标右键单击可前进90度）

　　绕屏幕法线轴自动旋转（鼠标右键单击可前进90度）

　　重置缩放和方向

　　隐藏/显示控制面板

　　切换透视/正交投影

　　立体模式（立体对，立体图）

　　插入的圆柱体/球的切换阴影（用于管和Bucky-ball）

　　切换Atom可见性打开/关闭

　　设置原子半径系数（也单击状态栏面板2左/右）

　　切换键可见性打开/关闭

　　设置键合宽度因子（也单击状态栏面板4左/右）

　　快捷键

　　Enter键：重新计算几何

　　向上/向下箭头键：绕屏幕水平轴旋转

　　左/右箭头键：绕垂直屏幕轴旋转

　　Shift +方向键：绕屏幕法线轴旋转

　　Ctrl +箭头键：绕上述轴提前90度

　　加号/减号键：放大/缩小

　　空格键：重设缩放和方向

　　鼠标使用

　　双击显示区域：重置缩放和方向

　　鼠标左键拖动：绕水平和垂直屏幕轴旋转

　　在显示区域左侧拖动鼠标右键：绕屏幕法线轴旋转

　　在显示区域的右侧拖动鼠标右键：放大/缩小

　　XY生成器工具

　　该工具用于通过从图像中提取XY图纸坐标集或手动组装原子数组来创建XY图纸坐标集。在这两种情况下，只需单击所需的位置即可删除或添加单个原子。可以从菜单[Tools] [XY-Sheet Generator]启动工具窗口。保存XY坐标集后，您可以从主窗口菜单[File] [Import XY Data]加载创建的数据文件。由于XY坐标是在屏幕坐标系中创建的，因此它们以像素为单位进行保存。将XY文件加载到主窗口时，将根据主窗口中键合长度的输入值重新解释和缩放坐标。

　　1.从图像中提取XY坐标

　　此处使用的图像位于子文件夹“ \ lib”（sample_XYimport.gif）中。

　　清除XY数据或选择原子阵列

　　打开图像文件（GIF，JPG，BMP）

　　图像中原子的近似半径[像素]

　　执行霍夫变换进行原子搜索

　　重绘当前XY数据

　　将XY数据另存为（* .xy）文件

　　单击显示区域以添加/删除原子

　　执行霍夫变换搜索后，应找到大多数原子。如果不是，请修改原子半径的值，然后再次运行搜索。如果仍然缺少原子，则可以通过单击所需位置来添加原子。如果发现了太多或重叠的原子，则可以通过使用鼠标右键单击来删除错误的原子。

　　2.手动组装XY坐标

　　首先单击“新建”按钮，以选择要创建的原子阵列的类型。

　　使用当前显示在主窗口中的管/锥中的图纸数据

　　创建一个蜂窝数组

　　创建一个正方形数组

　　在此创建了大约20 x 20 A的石墨烯片。单个原子已被删除。也可以拖动原子，但是原子碰撞运动仍需要改进。

　　纳米孔阵列发生器

　　金属屏幕中的纳米孔阵列已被用作聚焦光的透镜。 此工具从准周期性平铺图的顶点创建XY坐标集。 对偶方法应用于多网格，以生成准周期平铺，其顶点用作可能的纳米孔阵列的xy位置。

　　1.用户界面

　　单击＃5按钮以计算新切片。 如果拼贴中出现间隙，请增加“循环顺序”（Loop Order）的滑块值，以生成更多的拼贴/顶点。

　　查看准周期平铺（单击与＃5相同的图像）

　　查看孔阵列图像

　　查看XY表

　　查看傅立叶变换（单击[-] [+]调整亮度）

　　重新计算新的平铺

　　保存XY坐标文件

　　将图像复制到剪贴板