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PyMOL(三维分子模型软件)

PyMOL(三维分子模型软件)

 v2.2.0 官方版
  • 软件大小：367.0 MB
  • 更新日期：2020-01-09 11:52
  • 软件语言：简体中文
  • 软件类别：3D/CAD软件
  • 软件授权：免费版
  • 软件官网：
  • 适用平台：WinXP, Win7, Win8, Win10, WinAll
  • 软件厂商：

6分
软件评分

本地下载文件大小：367.0 MB

软件介绍 人气软件 下载地址

为您推荐： 图形图像

　　PyMOL是一个轻量级的三维分子模型软件，旨在为您提供全面的分子可视化系统。使用其集成的光线跟踪图形技术，它可以渲染具有更平滑的表面边界，增强的阴影和反射效果的3D分子结构。主界面非常的直观，这使得它甚至适合初学者。PyMOL支持多种图像格式，包括PDB，SDF和电子密度图。渲染的图像和影片可以保存在会话文件中，您可以与其他人共享这些文件，而不必担心对象布局可能会更改。总的来说，PyMOL为您带来了完善的三维分子模型生成与查看解决方案，有需要的朋友赶紧下载吧！

PyMOL(三维分子模型软件)

软件功能

　　借助此分子可视化系统，可以以3D模式对蛋白质，其密度，轨迹和表面进行细微分析

　　原生视网膜分辨率/ 4k显示支持

　　停靠/取消停靠并重新排列某些面板（生成器，反馈浏览器，音量编辑器）

　　支持触控板手势（捏放大/缩小，z旋转）

　　用于打开MAE文件，MTZ文件，地图和轨迹文件的专用对话框

　　新的APBS插件面板

　　pymolrc脚本编辑器，突出显示语法

　　属性编辑器

　　MPEG-4和GIF电影导出面板

　　Excel导出器插件（Windows和Mac）

　　通过从文件浏览器拖动到PyMOL窗口来打开文件

　　组合线/非粘合线和棒/ nb_spheres的导线和甘草制图表达别名

软件特色

　　该应用程序随附用于创建分子动画和电影的所有必要工具。可以旋转相机以更改视角，而称为RigiMOL的内置动画工具包括一组功能，可在不同结构之间生成分子形态。

　　可自定义的帧速率，自动插值，循环和光线跟踪成帧，图像帧缓存，慢动作模拟是此应用程序附带的其他优点。

　　可以将生成的PyMOL结构导出到VRML（虚拟现实标记语言），这使您可以使用第三方应用程序创建矢量图形或使用3D打印机打印模型。

　　PyMOL可以使用各种图像表示方法显示分子数据。您可以选择顺序模式，立体模式，正视视图，强调键连接性的线等。

　　该程序具有可自定义的颜色，结构标签，可调整的对象透明度，输出和控件大小，自动缩放，文本覆盖以及可自定义的鼠标控件。内置向导可帮助您测量结构，进行配对，添加标签等。

　　凭借其先进的渲染功能和电影生成工具，PyMOL是显示复杂分子结构和生成实时3D演示文稿的必备工具。

安装方法

　　1、下载并解压软件，双击安装程序进入PyMOL安装向导，单击【next】。

PyMOL(三维分子模型软件)

　　2、阅读许可协议，点击【I agree】按钮同意并进入下一步的安装。

PyMOL(三维分子模型软件)

　　3、选择安装类型，用户可以选择仅为个人安装与为计算机下的所有用户安装。

PyMOL(三维分子模型软件)

　　4、选择安装位置，用户可以选择默认的C:\Users\CS\PyMOL，也可以自定义。

PyMOL(三维分子模型软件)

　　5、进阶安装，您可以根据需要选择其他的安装选项。

PyMOL(三维分子模型软件)

　　6、开始进行安装，用户等到安装完成。

PyMOL(三维分子模型软件)

　　7、PyMOL安装向导完成。

PyMOL(三维分子模型软件)

使用方法

　　1、运行PyMO，进入如下所示的软件主界面。

PyMOL(三维分子模型软件)

　　2、在编辑菜单中提供了撤消、重做、撤消/重做的最大原子数、自动复制图像等多种功能。

PyMOL(三维分子模型软件)

　　3、在build一栏下提供了反转（pk2）-（pk1）-（pk3）、创建键（pk1）-（pk2）、删除（pk1）等多种功能。

PyMOL(三维分子模型软件)

　　4、在，movie一栏下提供了影格速率、自动插值、循环帧、光线跟踪帧、缓存帧图像、清除图像缓存等功能。

PyMOL(三维分子模型软件)

　　5、display一栏下支持顺序模式、内部GUI、内部提示、内部反馈、立体声、立体声模式、放大、色彩空间等。

PyMOL(三维分子模型软件)

　　6、在设置下提供了PDB文件加载、mmCIF文件加载、地图文件加载、自动缩放新对象、显示文字（Esc）、重叠文字等功能。

PyMOL(三维分子模型软件)

　　7、在scene一栏下提供了附加、在之前插入、在之后插入、更新资料、删除等多种功能。

PyMOL(三维分子模型软件)

　　8、在，mouse一栏下用户可以选择模式。

PyMOL(三维分子模型软件)

更新日志

　　特征：

　　具有基本样式（颜色，表示形式，标签）的MAE导出

　　具有组层次结构的MAE导出

　　核酸诱变向导

　　功能（仅限激励性PyMOL）：

　　具有属性的MAE导出

　　使用RDKit或$ SCHRODINGER后端进行立体化学（“立体”）标记（外部依赖性）

　　界面：

　　在对象菜单中分组：A>组> ...

　　从序列查看器更新二级结构：右键单击> ss> ...

　　Atom右键单击>对象>禁用其他

　　API：

　　每个链cmd.get_fastastr（）

　　cmd.get_fastastr（）用于核酸

　　运行时（conda程序包）：

　　Anaconda 5.0.0构建环境

　　适用于所有平台（Windows，Linux，macOS-64位）的Python 2.7和3.6

　　开源PyMOL更新：

　　将代码存储库移至github

　　从Incentive PyMOL移植的图形着色器和相关代码：

　　改进的标签：多行支持，背景色，连接器（各种label_ *设置）

　　支持背景图片（bg_image_filename）

　　与订单无关的透明度（透明模式3）

　　修复stick_ball设置

　　修复了某些低端图形驱动程序的“行”崩溃

　　Bug修复：

　　使用双通配符（A * B * C）选择

　　APBS插件：4位坐标处理（例如x> = 1000.0）

　　SDF导出：不要写零序债券

　　批处理模式下的立体浮雕立体声

　　all_states = on的状态之间的距离测量

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